רוב סוגי היתושים שנתקלים בהם לא יישאו את טפיל המלריה ואם אדם נעקץ זה לא אומר שהוא ידבק במלריה. מניעת מלריה מתחילה בהגנה על עצמך מפני עקיצות אשר צפויות להתרחש בין השעות 17:00-05:00. אמצעי מניעה שאפשר לנקוט יהיו: להישאר בחדר, למרוח דוחה יתושים, לכסות עור חשוף בבגדים, לישון עם כילה נגד יתושים או לשרוף סלילים נגד יתושים וקטורת. כילות נגד יתושים מצוידות בכל יחידות האירוח של קרוגר ואמצעי מניעה אחרים מוצעים בפארק ורבים מהפארקים בחנויות ומרכזים שונים. ניתן לרכוש תרופות מניעתיות למלריה מרוב המרפאות המקומיות או ממפיצי התרופות, אך יש להחליט על ההחלטה ליטול את התרופה המונעת בזהירות רבה. למניעה יש תופעות לוואי שונות שאליהן לאנשים מסוימים עשויים להיות תגובות שונות, ההחלטה לקחת את התרופה האמורה צריכה להילקח על פי יעוץ רפואי .